Büyük Kongre her yıl Haziran'ın ikinci yarısında toplanır.
Vazifeleri şunlardır:
1 – Merkez Konseyinin yıllık çalışma raporunu ve murakıpların raporunu incelemek,
2 – Merkez Konseyinin bilançosunu tetkik ve kabulü halinde ibra etmek,
3 – Bütçeyi tasdik etmek,
4 – Merkez Konseyince teklif edilen mevzuları müzakere etmek,
5 – Merkez Konseyi azalarını seçmek,
6 – Yüksek Haysiyet Divanı azalarını seçmek,
7 – Üç murakıp seçmek,
8 – Tabip odalarının ihtiyaçlarını tesbit etmek,
9 – Tabip odalarının içişlerini müzakere etmek,
10 – Tabip odalarının Merkez Konseyine gönderdikleri yıllık çalışma raporları hakkında bilgi edinmek,
11 – Kongreye arzedilen dilekleri müzakere ve yapılması gereken işleri tesbit etmek.